Kane marcó a los 20 y 56, mientras que Dele Alli anotó en el segundo minuto del descuento para Tottenham.
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Romelu Lukaku recortó distancias para el Everton en el 81. Y el ecuatoriano Enner Valencia puso un poco de emoción a los últimos segundos del encuentro con el 3-2 en el 93.
Kane es el mejor goleador inglés con 19 tantos esta temporada, mientras que Lukaku suma 18.
La última vez que Tottenham vieron escapar puntos de su feudo fue el 29 de octubre en el 1-1 contra el Leicester.
Con su triunfo, el equipo dirigido por Pochettino redujo a siete puntos su desventaja con el líder, el Chelsea.
No obstante, los «Blues» pueden mañana recuperar el margen si vencen al West Ham.